生物化学工学 電子のやりとりに連動した構造変化が鍵!コレラ菌の生育に必須のナトリウムポンプのはたらく仕組みを解明
2026-02-13 京都大学京都大学らの国際共同研究は、コレラ菌の生育に必須なナトリウムポンプNQRの作動原理を解明し、Nature Communicationsに発表した。低温電子顕微鏡(クライオEM)により、基質の酸化還元反応に伴いN...
分子動力学シミュレーション
生物化学工学 
生物化学工学 生体分子モーターの回転駆動機構を原子レベルで解明～「歪み」と「押し出し」から成る駆動力～
2025-08-20 理化学研究所理化学研究所らの研究グループは、生体分子モーター「F1-ATPase」の回転駆動機構を、スーパーコンピュータ「富岳」と分子動力学ソフト「GENESIS」を用いて原子レベルで解明しました。F1-ATPaseは...
細胞遺伝子工学 損傷したDNA修復の分子設計図をスーパーコンピューターが描く(Summit supercomputer draws molecular blueprint for repairing damaged DNA)
2025-03-12 オークリッジ国立研究所 (ORNL)The Summit supercomputer revealed how damaged strands of DNA are surgically repaired by a m...
生物工学一般 人工イオンチャネルの精密デザインに成功 ～膜ペプチドの集まる数を自在に制御して新機能の創出へ～
2025-03-28 理化学研究所,科学技術振興機構,ブリストル大学,キングス・カレッジ・ロンドン理化学研究所と英ブリストル大学などの国際研究チームが、自然界に存在しないタンパク質を理論設計し、人工イオンチャネルの作製に成功。複数のペプチド...
医療・健康 サルはなぜB型肝炎ウイルスに感染しないのか～ウイルス感染の「種間の壁」が生じる要因を解明～
2024-12-03 京都大学野村紀通 医学研究科准教授、塩野谷果歩 東京理科大学博士課程学生、渡士幸一 同客員教授(兼:国立感染症研究所治療薬開発総括研究官)、朴在鉉(パク ジェヒョン) 横浜市立大学研究員(研究当時)、浴本亨 同助教、池...
生物工学一般 分子シミュレーション×AIでトランスポータータンパク質の未解明構造を明らかにする
2024-01-26 分子科学研究所【発表のポイント】 トランスポータータンパク質は、自身の構造を切り替えることで特定の分子を細胞内外へ輸送する 分子シミュレーションと構造予測AIであるAlphaFold2によって、シュウ酸トランスポー...
医療・健康 筋萎縮性側索硬化症(ALS)の発症機構の一端を解明～タンパク質の高密度な凝縮構造が鍵～
2022-09-13 京都大学関山直孝 理学研究科助教、児玉高志 同研究員(現:大阪大学)、杤尾豪人 同教授、高場圭章 理化学研究所特別研究員、眞木さおり 同研究員、米倉功治 グループディレクター(東北大学教授を併任)らの共同研究グループは...
有機化学・薬学 新型コロナウイルスの遺伝子を複製するタンパク質にレムデシビル、アビガンが取り込まれる過程を解明(奥村久士グループ)
スーパーコンピューターを使って分子動力学シミュレーションを行い、薬剤であるレムデシビルやアビガンなどが新型コロナウイルスのRNA依存性RNAポリメラーゼ[注2]に取り込まれる過程を世界で初めて明らかにした。
生物化学工学 超好熱菌由来タンパク質の熱安定化機構の解明～超熱安定なタンパク質設計への新たな指針～
2018-05-21 理化学研究所理化学研究所(理研)放射光科学研究センター油谷克英嘱託職員らの共同研究チーム※は、「超好熱菌」が生産するタンパク質に非常に多く含まれる荷電性のアミノ酸(荷電性残基)が、変性状態でイオン対(塩結合)を形成する...
生物化学工学 1分子計測のデータ同化による生体分子構造ダイナミクス
小タンパク質が折り畳まれる際の中間構造・パスウェイを特定2018-05-15 理化学研究所理化学研究所(理研)計算科学研究センター粒子系生物物理研究チームの杉田有治チームリーダーと松永康佑研究員の研究チームは、データ同化技術をベースとして1...