2023-03-31 ワシントン大学セントルイス校
研究者たちは、移動性要素由来の転写産物である1,068のRNAセクションを同定し、これらの腫瘍抗原を新しい免疫療法のターゲットとして使用できる可能性を示した。研究者たちは、これらのタンパク質が腫瘍細胞の表面に存在することを発見し、ほとんどの腫瘍が少なくとも1つのポテンシャル抗原を持っていることがわかった。また、候補タンパク質の多くが、複数の腫瘍および腫瘍タイプで存在することが示され、ジャンプ遺伝子由来の最も一般的な腫瘍抗原のいくつかをターゲットとする単一のカクテルが多数のがんを治療できる可能性があると考えられている。
<関連情報>
- https://source.wustl.edu/2023/03/jumping-genes-in-cancer-cells-open-door-to-new-immunotherapies/
- https://medicine.wustl.edu/news/jumping-genes-in-cancer-cells-open-door-to-new-immunotherapies/
- https://www.nature.com/articles/s41588-023-01349-3
トランスポーザブル・エレメントに由来する腫瘍特異的抗原を汎癌解析で同定 Pan-cancer analysis identifies tumor-specific antigens derived from transposable elements
Nakul M. Shah,H. Josh Jang,Yonghao Liang,Ju Heon Maeng,Shin-Cheng Tzeng,Angela Wu,Noah L. Basri,Xuan Qu,Changxu Fan,Amy Li,Benjamin Katz,Daofeng Li,Xiaoyun Xing,Bradley S. Evans & Ting Wang
Nature Genetics Published:27 March 2023
DOI:https://doi.org/10.1038/s41588-023-01349-3
Abstract
Cryptic promoters within transposable elements (TEs) can be transcriptionally reactivated in tumors to create new TE-chimeric transcripts, which can produce immunogenic antigens. We performed a comprehensive screen for these TE exaptation events in 33 TCGA tumor types, 30 GTEx adult tissues and 675 cancer cell lines, and identified 1,068 TE-exapted candidates with the potential to generate shared tumor-specific TE-chimeric antigens (TS-TEAs). Whole-lysate and HLA-pulldown mass spectrometry data confirmed that TS-TEAs are presented on the surface of cancer cells. In addition, we highlight tumor-specific membrane proteins transcribed from TE promoters that constitute aberrant epitopes on the extracellular surface of cancer cells. Altogether, we showcase the high pan-cancer prevalence of TS-TEAs and atypical membrane proteins that could potentially be therapeutically exploited and targeted.
