環境圧力による特定の遺伝子の変化は、これまで考えられていたよりも古代人類に多く見られる可能性があることが判明 Certain genetic changes due to environmental pressures likely more common in ancient humans than previously thought
2022-11-02 ペンシルベニア州立大学(PennState)
これは、ウイルスや気候変動などの外的な圧力に反応して、ある集団のメンバー全員に希少な遺伝子変異が共通に見られるようになる現象である。このようなハードセレクティブスイープは、動物のゲノムではよく観察されるが、ヒトではまれであるように思われた。
研究者達は、一般に公開されているリポジトリからのデータを使って、ユーラシア大陸の1,000体以上の古代人骨(最も古いサンプルは約45,000年前)からの遺伝情報をまとめ、分析しました。
その結果、当初はまれだった有益な遺伝子変異が、ある古代人類集団の全メンバーに広く認められるようになったという、厳しい選択的スイープの事例が50件以上発見された。研究チームは、これらのハードセレクティブスイープを引き起こした環境要因をまだ特定できていないが、例えば、変異体の1つが免疫系に関連していることが確認された。
<関連情報>
- https://www.psu.edu/news/research/story/ancient-genomes-reveal-hidden-history-human-adaptation/
- https://www.nature.com/articles/s41559-022-01914-9
混血がヒトの歴史的なハードスイープのシグナルを不明瞭にした Admixture has obscured signals of historical hard sweeps in humans
Yassine Souilmi,Raymond Tobler,Angad Johar,Matthew Williams,Shane T. Grey,Joshua Schmidt,João C. Teixeira,Adam Rohrlach,Jonathan Tuke,Olivia Johnson,Graham Gower,Chris Turney,Murray Cox,Alan Cooper & Christian D. Huber
Nature Ecology and Evolution Published:31 October 2022
DOI:https://doi.org/10.1038/s41559-022-01914-9
Abstract
The role of natural selection in shaping biological diversity is an area of intense interest in modern biology. To date, studies of positive selection have primarily relied on genomic datasets from contemporary populations, which are susceptible to confounding factors associated with complex and often unknown aspects of population history. In particular, admixture between diverged populations can distort or hide prior selection events in modern genomes, though this process is not explicitly accounted for in most selection studies despite its apparent ubiquity in humans and other species. Through analyses of ancient and modern human genomes, we show that previously reported Holocene-era admixture has masked more than 50 historic hard sweeps in modern European genomes. Our results imply that this canonical mode of selection has probably been underappreciated in the evolutionary history of humans and suggest that our current understanding of the tempo and mode of selection in natural populations may be inaccurate.
