「古代」免疫細胞の変異が癌患者の生存に関連(Variations in ”ancient” immune cells linked to patients’ survival in cancer)

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2024-05-13 シンガポール国立大学(NUS)

シンガポール国立大学のがん科学研究所の研究チームは、拡散性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)における化学療法後の再発理解に進展を遂げました。この研究は、がん環境に存在する免疫細胞「マクロファージ」のバリエーションが患者の回復と生存に影響を与えることを発見しました。デジタル空間プロファイリング技術を用いて、マクロファージの分子特性を詳細に分析し、治療法の改善につながる可能性が示されました。この研究は、DLBCLだけでなく他のがん種にも応用可能な治療戦略の発見に寄与することが期待されます。

<関連情報>

びまん性大細胞型B細胞リンパ腫におけるマクロファージの不均一性と予後の重要性を明らかにする空間分解トランスクリプトミクス Spatially-resolved transcriptomics reveal macrophage heterogeneity and prognostic significance in diffuse large B-cell lymphoma

Min Liu,Giorgio Bertolazzi,Shruti Sridhar,Rui Xue Lee,Patrick Jaynes,Kevin Mulder,Nicholas Syn,Michal Marek Hoppe,Fan Shuangyi,Yanfen Peng,Jocelyn Thng,Reiya Chua,Jayalakshmi,Yogeshini Batumalai,Sanjay De Mel,Limei Poon,Esther Hian Li Chan,Joanne Lee,Susan Swee-Shan Hue,Sheng-Tsung Chang,Shih-Sung Chuang,K. George Chandy,Xiaofei Ye,Qiang Pan-Hammarström,… Anand D. Jeyasekharan
Nature Communications  Published:08 March 2024
DOI:https://doi.org/10.1038/s41467-024-46220-z

「古代」免疫細胞の変異が癌患者の生存に関連(Variations in ”ancient” immune cells linked to patients’ survival in cancer)

Abstract

Macrophages are abundant immune cells in the microenvironment of diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL). Macrophage estimation by immunohistochemistry shows varying prognostic significance across studies in DLBCL, and does not provide a comprehensive analysis of macrophage subtypes. Here, using digital spatial profiling with whole transcriptome analysis of CD68+ cells, we characterize macrophages in distinct spatial niches of reactive lymphoid tissues (RLTs) and DLBCL. We reveal transcriptomic differences between macrophages within RLTs (light zone /dark zone, germinal center/ interfollicular), and between disease states (RLTs/ DLBCL), which we then use to generate six spatially-derived macrophage signatures (MacroSigs). We proceed to interrogate these MacroSigs in macrophage and DLBCL single-cell RNA-sequencing datasets, and in gene-expression data from multiple DLBCL cohorts. We show that specific MacroSigs are associated with cell-of-origin subtypes and overall survival in DLBCL. This study provides a spatially-resolved whole-transcriptome atlas of macrophages in reactive and malignant lymphoid tissues, showing biological and clinical significance.

医療・健康
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