がん免疫療法、なぜ効かなくなる?治療に抵抗する“悪玉サブクローン”の正体を解明

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2025-09-01 慶應義塾大学医学部,東京大学大学院理学系研究科,東京科学大学

慶應義塾大学・東京大学・東京科学大学の研究グループは、転移性尿路上皮がんにおける免疫チェックポイント阻害薬の耐性獲得メカニズムを解明しました。剖検例を対象に多領域オミクス解析を行った結果、治療中に一部のがん細胞サブクローンが新たな遺伝子変異を獲得し、がん悪化の原因となる「悪玉サブクローン」として増殖することが判明。さらに、空間トランスクリプトミクスや単一細胞解析により、これらのサブクローンは腫瘍微小環境に適応し、免疫抑制環境を形成して治療抵抗性をもたらすことが示されました。本成果は「悪いリンゴ(bad apple)」概念を裏付けるものであり、免疫チェックポイント阻害薬の効果を高めるためのサブクローン標的療法や免疫微小環境の改変戦略へとつながる可能性があります。研究成果は2025年8月27日付で Nature Communications に掲載されました。

がん免疫療法、なぜ効かなくなる?治療に抵抗する“悪玉サブクローン”の正体を解明

<関連情報>

クローン多様性が腫瘍微小環境を形成し、転移性尿路上皮癌における免疫療法反応の差異をもたらす Clonal diversity shapes the tumour microenvironment leading to distinct immunotherapy responses in metastatic urothelial carcinoma

Takashi Kamatani,Kota Umeda,Tomohiro Iwasawa,Fuyuki Miya,Kazuhiro Matsumoto,Shuji Mikami,Kensuke Hara,Masayuki Shimoda,Yutaka Suzuki,Jo Nishino,Mamoru Kato,Kazuhiro Kakimi,Nobuyuki Tanaka,Mototsugu Oya & Tatsuhiko Tsunoda
Nature Communications  Published:27 August 2025
DOI:https://doi.org/10.1038/s41467-025-63309-1

Abstract

Repeated oncogenic mutations and polyclonal proliferation are evident in cancers. However, little is known about the polyclonal principles governing the systemic cancerous lineage during immunotherapy. Here, we examine a unique autopsy case of metastatic urothelial carcinoma that exhibits different treatment responses to anti-PD-1 therapy at each tumor site. By performing in-depth analyses of different multiregional bulk tumor masses, we reveal that subsets of subclones acquire potential driver mutations under treatment selection pressure. Spatial transcriptomics analysis reveals that subclones resistant to immunotherapy form distinct immunosuppressive environments consistent with their habitats. Furthermore, different cancer hallmarks are identified in each of the subclones that expand under immunotherapy at single-cell level; for example, one subclone is more proliferative, and another is more stem-cell-like. In summary, this study provides an overall picture of the polyclonal competition and changes in the immune microenvironment that are related to resistance to immunotherapy in patients with malignancies.

医療・健康
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