2020-09-07 国立遺伝学研究所
The dynamics, causes and impacts of mammalian evolutionary rates revealed by the analyses of capybara draft genome sequences
Isaac Adeyemi Babarinde and Naruya Saitou
Genome Biology and Evolution (2020) evaa157 DOI:10.1093/gbe/evaa157
哺乳類の中でも特にネズミの仲間である齧歯類のDNAの進化は特殊です。そこで、齧歯類のなかで最大の体重を有するカピバラの概要ゲノム配列を決定し解析しました。
その結果、カピバラゲノムの大きさはヒトゲノムの80%程度であることが判明しました。さらに、他の哺乳類のゲノムと比較した結果、カピバラはモルモットよりも60倍体重が大きいが、両者のゲノム進化速度は似通っていることが明らかになりました。このように、どの系統群に属するのかという要因のほかに、世代時間と一度に産む子供数が中立進化速度と相関していました。また、肝臓トランスクリプトーム解析を行なった結果、遺伝子の発現パターンがこれらの進化速度に影響されていることがわかりました。
今後も、未だゲノム配列の決定されていない哺乳類に着目し、そのゲノム配列を決定・解析することで哺乳類の形態進化をゲノムデータから推定していきます。
本研究は、情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 集団遺伝学研究室のアイザック・ババリンデ博士（総研大遺伝学専攻卒業生）と斎藤成也教授によって実施されました。
本研究成果は、英国科学雑誌「Genome Biology and Evolution」に2020年8月24日に掲載されました。
写真: ありし日のカピバラ「雷ちゃん」（写真提供：伊豆シャボテン動物公園）
