2023-03-15 オークリッジ国立研究所(ORNL)
これは、ファージのライフサイクルに関する重要な情報を提供するとともに、人間病原体を対象とする治療法や、植物の生産から炭素隔離まで、ファージと細菌の相互作用を制御する方法の開発につながる可能性があります。
研究者たちは、人間の排便物から採取した培養されていないファージを使用し、ファージタンパク質が宿主生物でどのように発現されるかを明らかにするために、高性能質量分析法を使用して、この理論を実験的に初めて検証しました。
<関連情報>
- https://www.ornl.gov/news/research-team-proves-bacteria-killing-viruses-deploy-genetic-code-switching-deceive-hosts
- https://www.nature.com/articles/s41467-022-32979-6
ヒトマイクロバイオームファージが代替遺伝暗号を使用することを実験的に確認 Experimental validation that human microbiome phages use alternative genetic coding
Samantha L. Peters,Adair L. Borges,Richard J. Giannone,Michael J. Morowitz,Jillian F. Banfield & Robert L. Hettich
Nature Communications Published:29 September 2022
DOI:https://doi.org/10.1038/s41467-022-32979-6
Abstract
Previous bioinformatic analyses of metagenomic data have indicated that bacteriophages can use genetic codes different from those of their host bacteria. In particular, reassignment of stop codon TAG to glutamine (a variation known as ‘genetic code 15’) has been predicted. Here, we use LC-MS/MS-based metaproteomics of human fecal samples to provide experimental evidence of the use of genetic code 15 in two crAss-like phages. Furthermore, the proteomic data from several phage structural proteins supports the reassignment of the TAG stop codon to glutamine late in the phage infection cycle. Thus, our work experimentally validates the expression of genetic code 15 in human microbiome phages.
