細胞遺伝子工学 Dicer-2タンパク質は長い二本鎖RNAを連続的に切断する
1分子イメージング技術を用いて、昆虫において二本鎖RNAを切断するDicer-2がはたらく様子を直接観察することに世界で初めて成功した。
細胞遺伝子工学 
生物工学一般 平面状の細胞シートが立体的に！細胞が自分の力でシートを３次元化
イオンビーム加工技術を駆使し、細胞が接着面を引っ張るごく小さな力で容易に変形する「フレキシブル細胞培養薄膜」を開発。
有機化学・薬学 細胞染色画像からたんぱく質の共変動ネットワークを構築
単一細胞内のたんぱく質の質的・時空間的（局在）変化に基づく新たな「ＰＬＯＭ－ＣＯＮ解析法」を開発、ＰＬＯＭ－ＣＯＮ解析法を用いて、インスリン刺激された肝細胞内に一過性に生じるアクチンドメインの新機能を予測・解明する共変動ネットワークを構築。
生物工学一般 3タイプの性別を藻類・菌類の同一種内で初めて発見: 相模川水系のボルボックス類に潜む両性型3番目の性(sex)
長期間にわたる相模川水系の湖沼のフィールド調査と培養・交配実験から緑藻プレオドリナの同一種がメスとオスに加えて両性型の３番目の性表現型を持つことを明らかにした。
細胞遺伝子工学 遺伝子の構造が「密」になると遺伝子の働きが抑制される
「遺伝子の働く強さを調節する仕組み」をヒトの細胞を使って解明した。遺伝子が巻き付いている円柱状の構造物「ヌクレオソーム」に着目し、超遠心分離機を用いたヌクレオソーム解析法を新たに開発し、数個のヌクレオソームが「密」に集まる時には遺伝子の働きが抑えられ、「疎」に散らばるほど遺伝子が強く働くことが明らかになった。
細胞遺伝子工学 卵母細胞の老化を1細胞で捉える～ライフステージと食餌制限によるトランスクリプトーム変化～
生殖寿命の初期、中期、後期にあたる雌マウス卵母細胞の全遺伝子発現（トランスクリプトーム）解析を行い、卵母細胞の老化に伴うトランスクリプトーム変化や、食餌制限（カロリー制限）により卵母細胞の老化が抑制される可能性を明らかにした。
生物工学一般 データからばらつき成分を取り除き、隠れた細胞分裂の法則を推定する機械学習手法を開発
大腸菌など分裂を繰り返す単細胞生物のサイズ変化を計測したデータから、細胞分裂時のサイズを制御する法則を推定する手法を提案した。
細胞遺伝子工学 ハクサイの遺伝子発現調節機構を解明
ハクサイにおいて、遺伝子発現調節に重要なヒストンの化学修飾であるH3K4me3とH3K36me3の役割を明らかにした。
生物工学一般 高分解能で見るアミロイド線維形成 ～アルツハイマー病やALSなどの発症機構理解のための新たな研究手法～
神経変性疾患発症に関わるタンパク質のアミロイド線維化過程を原子分解能という高分解能でモニターすることに世界で初めて成功した。
医療・健康 小麦による食物アレルギーのリスク因子を発見
食物アレルギーの特殊なタイプである小麦依存性運動誘発アナフィラキシー（WDEIA）の患者を対象としたゲノムワイド関連解析（GWAS）により、WDEIAの発症リスクが、特定のHLA型である「HLA-DPB1*02:01:02」と関連することを発見した。
医療・健康 難治性の傷を治す人工タンパク質の企業治験を開始します
2021-07-09 京都大学,三洋化成工業株式会社森本尚樹 医学研究科教授らと三洋化成工業株式会社は、慢性創傷の治療を目的に、新規治療材料シルクエラスチン（R）スポンジの共同開発を行っています。この度、2021年7月より本材料の有効性の確...
生物化学工学 組織透明化手法と細胞周期観察蛍光プローブ Fucci を組み合わせ、がん転移並びに抗がん剤耐性メカニズムの解明に有用なイメージング手法を確立
組織透明化手法と細胞周期を観察することができる蛍光プローブ Fucci（フーチ）を組み合わせ、マウス臓器内のがん転移の細胞周期を観察した。転移先臓器の違いによりがん転移の形や大きさ、細胞周期パターンに違いがあるだけでなく、同一臓器内のがん転移巣の間でも腫瘍の細胞周期パターンに違いがあることが示唆された。