小笠原諸島の絶滅危惧のハト 個体数増加の背景に遺伝的浄化

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2025-08-19 京都大学

京都大学と東京動物園協会などの研究グループは、小笠原諸島固有の絶滅危惧種アカガシラカラスバトのゲノム解析を行い、長年の隔離環境において「遺伝的浄化」が進んでいたことを発見しました。遺伝的浄化とは、有害な突然変異が自然選択によってゲノムから除去される現象で、個体群の回復力維持に寄与します。アカガシラカラスバトは2000年代に数十羽まで減少し「幻の鳥」とも呼ばれましたが、外来種ノネコの駆除により個体数が急増。本研究により、その背景に遺伝的浄化が作用し、近交弱勢の影響が比較的少なかった可能性が示されました。これは絶滅危惧種保全に新たな視点を与える成果であり、今後の保護増殖事業や遺伝的リスク評価に活用が期待されます。本研究成果は国際誌 Communications Biology に掲載されました。

小笠原諸島の絶滅危惧のハト 個体数増加の背景に遺伝的浄化
小笠原諸島の絶滅危惧種アカガシラカラスバト。2000年代には「幻の鳥」とまで言われたが、近年では住宅地の近くでも見られるようになった。(撮影:辻本大地、井鷺裕司)

<関連情報>

絶滅の危機から回復中の島固有のハトにおける遺伝的浄化 Genetic purging in an island-endemic pigeon recovering from the brink of extinction

Daichi Tsujimoto,Mayo Takayanagi,Jyunko Ishii,Ryouko Sakashita,Kazuo Horikoshi,Hajime Suzuki & Yuji Isagi
Communications Biology  Published:15 July 2025
DOI:https://doi.org/10.1038/s42003-025-08476-z

Abstract

In many endangered species with increased homozygosity, population recovery is limited by expressed deleterious mutations. In contrast, the critically endangered red-headed wood pigeon, endemic to an isolated oceanic archipelago of ~100 km2, experienced a dramatic population increase three years after the removal of introduced predators, despite being nearly extinct in the 2000s. To understand the reason for this recovery, we sequenced and analysed its genome. We find that over 80% of the genome is homozygous due to centuries of inbreeding, yet the frequency of highly deleterious mutations is lower than in widespread conspecifics. Linkage disequilibrium-based analysis suggests that the effective population size declined from several thousand to fewer than a hundred in the early 20th century due to human impacts. Gradual inbreeding in a historically small population before human impact may have purged part of the mutation load, facilitating the recovery. Our study highlights the role of historical demography in the persistence of bottlenecked populations, with implications for biological conservation.

生物環境工学
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