「エンハンサー・ハイジャック」により駆動される、極めて高リスクなT細胞性急性リンパ性白血病の新たなサブタイプを発見

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2026-03-10 国立がん研究センター,東北大学

国立がん研究センターと東北大学の研究グループは、T細胞性急性リンパ性白血病(T-ALL)の新たな高リスクサブタイプを発見し、その発症機構を解明した。全ゲノムシークエンシングやRNAシークエンシングを用いた解析により、14番染色体と16番染色体が入れ替わる「t(14;16)(q32;q24)転座」を特定。この転座により、本来BCL11B遺伝子を制御するエンハンサーが別の遺伝子群(FENDRR、FOXF1、FOXC2)の近くへ移動し、遺伝子が異常活性化する「エンハンサー・ハイジャック」が起こることが明らかになった。特にFOXF1の異常活性化は細胞の分化異常や薬剤耐性に関与し、標準治療への抵抗性や予後不良につながると考えられる。このサブタイプは既存の臨床検査では検出が難しく、診断にはゲノム解析などの新しい検査法が重要となる。今回の発見は原因不明のT-ALLの一部を分類可能にし、将来的な診断法や新規治療開発につながる成果である。

「エンハンサー・ハイジャック」により駆動される、極めて高リスクなT細胞性急性リンパ性白血病の新たなサブタイプを発見

<関連情報>

t(14;16)(q32;q24)転座によるBCL11Bエンハンサーハイジャックは、T-ALLの新たな高リスクサブタイプを定義する BCL11B enhancer hijacking by t(14;16)(q32;q24) translocation defines a novel high-risk subtype of T-ALL

Yoji Sasahara,Yoko Mizoguchi,Maiko Shimomura,Ryosuke Koyamada,Rintaro Ono,Daisuke Hasegawa,Kazuki Mitani,Hirohito Kubota,Satoshi Yoshihara,Nobuhiro Hiramoto,Akihito Otsuki,Yasunobu Okamura,Fumiki Katsuoka,Kengo Kinoshita,Masataka Hasegawa,Marina Togo-Ohno,Hirona Maeda,Nobuyuki Kakiuchi,Mai Takeuchi,Aiko Sato-Otsubo,Shota Kato,Kentaro Watanabe,Kotoe Katayama,Seiya Imoto,Yuichi Shiraishi,Katsuyoshi Koh,Souichi Suenobu,Eiso Hiyama,Susumu Goyama,Atsuo Kikuchi,Seishi Ogawa,Motohiro Kato,Yasuhito Nannya,Junko Takita,Kenichi Yoshida
Blood  Published:March 6, 2026
DOI:https://doi.org/10.1182/blood.2025031466

Key Points

  • We identified a novel T-ALL subtype with poor outcomes, overexpressing FENDRR, FOXF1, and FOXC2 through BCL11B enhancer hijacking.
  • This subtype is characterized by frequent GATA3 mutations, marked lineage ambiguity, and enrichment in adolescents and young adults.

The molecular classification of T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) remains incomplete, limiting risk stratification and the development of targeted therapies. Enhancer hijacking is a critical oncogenic mechanism that deregulates proto-oncogenes by repositioning cis-regulatory regions via structural variants. Here, we performed an integrated analysis of pediatric and adult T-ALL and mixed phenotype acute leukemias (MPALs), using whole-genome and whole-transcriptome sequencing. This analysis identified a group of 14 patients with predominantly T-lineage neoplasms driven by a t(14;16)(q32;q24) translocation, harboring universal GATA3 mutations and CDKN2A/B deletions. Mechanistically, this translocation repositions the ThymoD locus downstream of BCL11B, causing monoallelic, ectopic overexpression of FENDRR and mesenchymal transcription factor genes FOXF1 and FOXC2, activating epithelial-mesenchymal transition (EMT) transcription signatures. Immunophenotypic and single-cell RNA-seq analyses revealed marked lineage ambiguity with myeloid and B-cell differentiation potentials specific to this subtype. Furthermore, functional analyses in CD34-positive cord blood cells demonstrated that FOXF1 overexpression promotes myeloid differentiation while suppressing T-cell differentiation, serving as a key factor for lineage specification. Clinically, this subtype was detected in 0.15-4.0% of T-ALL/MPAL cases depending on the cohort, showing a median age of 15 years and enrichment in adolescents and young adults (AYA). Importantly, patients with t(14;16)(q32;q24) have an extremely poor prognosis, showing a trend toward worse outcomes than high-risk groups such as KMT2A-rearranged early T-cell progenitor (ETP)-like, SPI1-rearranged, and LMO2 γδ-like T-ALLs. The unique molecular landscape and poor prognosis of patients with the t(14;16)(q32;q24) translocation underscore the need for the development of novel subtype-specific therapeutic approaches.

細胞遺伝子工学
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