未知の小腸がん遺伝子「COPA」を発見 -新たな発がん経路を解明-

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2025-06-15 慶應義塾大学医学部,国立がん研究センター,科学技術振興機構

慶應義塾大学医学部と国立がん研究センターの研究グループは、小腸腫瘍の新たな原因遺伝子としてCOPA遺伝子変異を発見し、従来とは異なる発がん経路の存在を明らかにした。小腸腫瘍の多くは平坦な形状を示すことが知られているが、本研究では丈の高い隆起型腫瘍がCOPA変異を起源として発生することを解明した。COPAは細胞内でタンパク質輸送を担う分子であり、これまで知られていた細胞増殖を直接促進する典型的ながん遺伝子とは異なる特徴を持つ。研究チームは正常な腸幹細胞にCOPA変異を導入し、実際に腫瘍形成が誘導されることを実証した。また、COPA変異を有する腫瘍の一部は小腸がんへ進展しやすく、特定の増殖因子への依存性を示すことも判明した。これらの結果から、COPA変異は小腸腫瘍の発生だけでなく悪性化にも関与する可能性が示された。本研究は、小腸がんの新しい分子メカニズムを解明した成果であり、COPA変異を標的とした診断法や治療法の開発につながることが期待される。研究成果はNature Genetics誌に掲載された。

未知の小腸がん遺伝子「COPA」を発見 -新たな発がん経路を解明-
図1:a. 平坦型小腸腺腫と隆起型小腸腺腫の肉眼および病理形態の違い。b. 隆起型小腸腺腫3 例のエキソーム解析によって同定されたCOPA遺伝子のインフレーム欠損。c. 小腸腺腫および十二指腸腺がんにおけるCOPA遺伝子変異の頻度。COPA変異は隆起型腺腫および腺がんでの頻度が高いことがわかる。

<関連情報>

COPA変異は腸管腫瘍においてR-spondin非依存的なWnt活性化を駆動する Recurrent COPA mutation drives R-spondin-independent Wnt activation in intestinal tumors

Masayuki Fujii,Naoko Abeto,Shotaro Kishimoto,Kouya Shiraishi,Taiki Hashimoto,Nobuyoshi Hiraoka,Satoru Nonaka,Motohiro Kojima,Mami Matano,Sirirat Takahashi,Gabriele Colozza,Bon-Kyoung Koo,Yasushi Yatabe,Motohiko Kato,Toshiro Sato & Shigeki Sekine
Nature Genetics  Published:12 June 2026
DOI:https://doi.org/10.1038/s41588-026-02616-9

Abstract

The majority of intestinal tumors harbor mutations in canonical Wnt pathway genes such as APC, whereas the lack of such alterations in a subset of tumors implies alternative tumorigenic routes. Here we identify recurrent in-frame deletion in COPA, frequently co-occurring with USP9X-truncating mutation, in small intestinal adenoma and adenocarcinoma. Patient-derived and CRISPR-engineered small intestinal organoids carrying COPA in-frame deletions exhibit R-spondin-independent yet Wnt ligand-dependent growth, maintaining LGR5 expression without canonical Wnt drivers. Mechanistically, COPA mutation stabilizes the Frizzled coreceptor LRP6 irrespective of R-spondin, sustaining Wnt pathway activation under growth factor-restricted conditions. USP9X loss further potentiates this phenotype. Unlike canonical Wnt pathway members, COPA encodes the α-subunit of coatomer complex I, which engages in vesicle trafficking with little prior linkage to intestinal tumorigenesis. Our findings establish COPA mutation as a unique and atypical intestinal tumor driver and implicate USP9X loss as a cooperating lesion.

医療・健康
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