DNA制御の仕組みをより鮮明に解析する新ツール(New tool gives scientists a clearer view of how DNA is regulated)

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2026-07-06 シンガポール国立大学(NUS)

シンガポール国立大学(NUS)癌科学研究所の研究チームは、DNA上の特定領域で協調して働くタンパク質群を高精度に同定する新手法「qChIP-MS」を開発した。遺伝子発現はDNAに結合する多数のタンパク質の相互作用によって制御されるが、従来の解析法では個々のタンパク質の検出が中心で、複数のタンパク質複合体を同時に解析することは困難だった。qChIP-MSは、クロマチン免疫沈降(ChIP)と質量分析(MS)を組み合わせ、特定のDNA領域に集まるタンパク質群を包括的かつ高感度に検出できる。これにより、DNA制御に関与するタンパク質ネットワークを詳細に解析し、転写制御やクロマチン構造の変化をより正確に理解できるようになった。研究では、この手法を用いて遺伝子発現を制御する複数の新たなタンパク質相互作用を明らかにし、がんや遺伝性疾患に関連するDNA制御機構の解明にも有効であることを示した。本技術は、疾患発症メカニズムの理解を深めるとともに、新たな創薬標的の探索やゲノム医療の発展への貢献が期待される。

<関連情報>

qChIP-MSは、ラベルフリー定量プロテオミクスによって局所的なクロマチン組成を明らかにする qChIP-MS reveals the local chromatin composition by label-free quantitative proteomics

Wai Khang Yong,Nurkaiyisah Zaal Anuar,Zi Wayne Sin,Elayne Su Ru Tan,Grishma Rane,Xiaoman Shao,Chai Yeen Goh,Vartika Khanchandani,Vivian L. S. Kuan,Peh Fern Ong,Maya Jeitany,H. Phillip Koeffler,Lih-Wen Deng,Oliver Dreesen,Takaomi Sanda & Dennis Kappei
Nature Communications  Published:26 May 2026
DOI:https://doi.org/10.1038/s41467-026-73609-9  Unedited version

Abstract

Chromatin immunoprecipitation (ChIP) has been a cornerstone for epigenetic analyses over the last decades, but even coupled to sequencing approaches (ChIP-seq), it is ultimately limited to one protein at a time. In a complementary effort, we here combine ChIP with label-free quantitative mass spectrometry (qChIP-MS) to interrogate local chromatin compositions. We demonstrate the versatility of our approach at telomeres, with transcription factors, in tissue and by dCas9-mediated locus-specific enrichment.

細胞遺伝子工学
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