哺乳類ゲノムが明かす重層的なインド太平洋域の交流史~ジャコウネズミが記録していたアラビア海から東アジアまで広がる海上交易ネットワーク~

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2026-07-13 北海道大学

北海道大学の大舘智志助教らの研究グループは、ジャコウネズミの全ゲノムとミトコンドリアDNAを解析し、インド洋から東南アジア、日本列島に至る広域的な移動史を解明した。住家性のジャコウネズミは人類の移動や海上交易に伴って分布を拡大したと考えられ、東アジア、東南アジア、南アジア、中東、東アフリカ、インド洋島嶼の試料を比較した結果、日本では九州系統と琉球系統が異なる起源を持つことを再確認した。また、東南アジア・中国南部・日本南部の個体群は東南アジア大陸部由来、西アジア・東アフリカ・マダガスカルなどの個体群はインド西部由来の系統と近縁であることが判明した。さらに、ミャンマーやスリランカには独自の系統が存在し、イエメンとマダガスカル、イランと東アフリカ沿岸、モーリシャス・レユニオン島と東南アジアとの遺伝的つながりも確認された。これらの結果は、ジャコウネズミが古代から近代に至る複数回の海上交易や人類移動を記録していたことを示し、インド太平洋域の交流史を復元する新たな手法を提示した。

哺乳類ゲノムが明かす重層的なインド太平洋域の交流史~ジャコウネズミが記録していたアラビア海から東アジアまで広がる海上交易ネットワーク~
イラン南西部のジャコウネズミ。

<関連情報>

真無盲腸目・トガリネズミ科)のゲノム構造と生物地理学的歴史:南アジア及びインド洋地域における複数回の分散イベントの解明 Genomic structure and biogeographic history of the Asian house shrew, Suncus murinus–montanus species complex (Eulipotyphla: Soricidae), reveal multiple dispersal events across southern Asia and the Indian Ocean region

Hayato Torisu,Hitoshi Suzuki,Kazumichi Fujiwara,Satoru Arai,Saw Bawm,Chandika D Gamage,Masaharu Motokawa,Abdul Karim Nasher,Hasmahzaiti Omar,Marie Claudine Ranorosoa,…
Zoological Journal of the Linnean Society  Published:01 July 2026
DOI:https://doi.org/10.1093/zoolinnean/zlag101

Abstract

The Asian house shrew (Suncus murinus–S. montanus species complex) is a small soricid mammal widely distributed across southern Asia and the Indian Ocean region. We examined the relative contributions of long-term natural divergence and human-mediated dispersal in shaping the genetic structure of house shrew populations across their geographic range. Previous studies have suggested that human-mediated introductions influenced its distribution, but comprehensive genome-wide analyses across the entire range have been lacking. Here, we analyse whole-genome data from 29 individuals and mitochondrial sequences from 219 individuals sampled across its range. Phylogenetic network analyses based on genome-wide single nucleotide variants revealed four major lineages: (i) the East-Southeast Asia main lineage, (ii) the Myanmar main lineage, (iii) the Sri Lanka lineage, and (iv) the South Asia–western Indian Ocean region lineage. Genomic analyses indicate recent admixture among regional populations, consistent with hybridization. Mitochondrial phylogenetic analyses further suggest human-mediated range expansion across regions. Divergence-time estimates indicate that dispersal events in Southeast Asia occurred after the onset of the Holocene. These results demonstrate that the present distribution of the Asian house shrew has been shaped by both natural divergence and recent human-mediated dispersal.

細胞遺伝子工学
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