「人目につかないところに潜んでいた」―前立腺がん患者のDNAサンプルから新たな細菌が発見される(‘Hiding in plain sight’ – new bacteria discovered in DNA samples from prostate cancer patients)

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2026-10-20 イースト・アングリア大学(UEA)

英国イースト・アングリア大学の研究チームは、前立腺がん患者のDNA配列データを再解析し、これまで記載されていなかった18種の細菌のゲノムを特定した。国際共同研究コンソーシアム「Pan Prostate Cancer Group」が収集した、9か国・2,000例以上の前立腺がんに関するデータのうち、2,176件のシーケンスデータを分析した。通常の解析ではヒト由来ではないとして除外されるDNA断片に着目し、メタゲノムアセンブリによって細菌ゲノムを再構築した結果、194人の患者由来データから249個のほぼ完全な細菌ゲノムを回収し、そのうち18種を新種と判定した。多くは口腔内に関連する細菌で、Porphyromonas属やTreponema属などが含まれる。研究チームは新たな細菌の培養条件を予測し、1種を検出するDNA検査法も開発した。これにより、細菌種ごとの性質や前立腺がんの進行との関連を詳しく調べる道が開かれた。ただし、これらの細菌が前立腺がんを引き起こす、あるいは進行させることが証明されたわけではない。

「人目につかないところに潜んでいた」―前立腺がん患者のDNAサンプルから新たな細菌が発見される(‘Hiding in plain sight’ – new bacteria discovered in DNA samples from prostate cancer patients)
Most came from the mouth, including new types of Porphyromonas, which the team has previously linked to more aggressive prostate cancer, and Treponema.

<関連情報>

前立腺がん患者の唾液、腫瘍、血液の全ゲノムシーケンスデータから嫌気性細菌ゲノムを回収する Recovering anaerobic bacterial genomes in saliva, tumour and blood whole genome sequencing data from patients with prostate cancer

A. Gihawi, A. Bampalis, S. Subramanian, Pan Prostate Cancer Group, G. S. Bova, A. Butler, N. M. Corcoran, F. Favero, V. Gnanapragasam, A. Hamid, C. Jung, Z. Kote Jarai, G. Leeman, M. Loda, J. Reimand, A. Sahli, T. Schlomm, T. N. Yamaguchi, J. Weischenfelft, C. Hovens, B. Pope, R. Bristow, M. N. Brook, K. C. L. Cheng, … D. S. Brewer
npj Biofilms and Microbiomes  Published:20 October 2026
DOI:https://doi.org/10.1038/s41522-026-01140-2

Abstract

Microbial constituents in the gastrointestinal tract, the urine and prostate tissue are being linked with clinical differences in prostate cancer, and a recent meta-analysis has linked periodontal disease to this cancer. Several hypotheses exist regarding how specific bacteria can contribute towards the development of prostate cancer. Recovering microbial genomes, and their genomic features, from clinical samples and investigating fine-scale taxonomy is a critical first step in investigating causality. Here, we describe the microbial diversity of samples associated with prostate cancer. Metagenomic assembly of non-human reads from the PanProstate Cancer Group, derived from blood, saliva samples and prostate tissue whole-genome data (N = 247), successfully reconstructed 249 highly complete bacterial genomes, predominantly from oral samples. Our data, reveals eighteen bacterial species from the oral cavity without species level classification, while demonstrating a wide range of known species. This approach enables us to gain additional insights of the microbes in cancer patients at no additional sequencing cost and has the potential to reveal new links that could improve our understanding of cancer initiation and development.

細胞遺伝子工学
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