免疫チェックポイント阻害薬抵抗性と関連する MTAP遺伝子欠損の臨床的意義を解明―全国大規模がんゲノムスクリーニングによる包括的研究―

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2026-05-22 国立がん研究センター

国立がん研究センター東病院の研究グループは、全国規模のがんゲノムスクリーニング「SCRUM-Japan MONSTAR-SCREEN」を用い、MTAP遺伝子欠損の臨床的意義を包括的に解析した。進行固形がん764例を解析した結果、MTAP欠損は約9%に認められ、特に膵臓がん、尿路上皮がん、胆道がんで高頻度だった。MTAP欠損例では全生存期間中央値が14.8か月と、野生型の37.4か月より有意に短く、独立した予後不良因子であることが判明した。また、免疫チェックポイント阻害薬治療に対する抵抗性も確認され、無増悪生存期間は中央値3.4か月と短縮していた。さらに、トランスクリプトーム解析により、MTAP欠損がんではT細胞浸潤の低下や免疫関連経路の抑制が確認され、免疫応答低下の分子基盤が示された。研究は、PRMT5阻害薬やMAT2A阻害薬を利用した新規治療戦略開発の科学的根拠となる成果であり、論文は「Clinical Cancer Research」に掲載された。

免疫チェックポイント阻害薬抵抗性と関連する MTAP遺伝子欠損の臨床的意義を解明―全国大規模がんゲノムスクリーニングによる包括的研究―

<関連情報>

進行性固形腫瘍におけるMTAP欠損の包括的なゲノムおよびトランスクリプトーム解析 Comprehensive Genomic and Transcriptomic Characterization of MTAP Loss Across Advanced Solid Tumors

Kyosuke Seguchi;Takao Fujisawa;Sadakatsu Ikeda;Yu Oyama;Norio Nonomura;Chigusa Morizane;Hiroji Iwata;Susumu Okano;Hidemichi Watari;Kenjiro Namikawa;Shigenori Kadowaki;Makoto Ueno;Eiji Oki;Shogen Boku;Satoshi Yuki;Wataru Yamagami;Tomohiro Nishina;Toshihiro Kudo;Naoki Takahashi;Hideaki Bando;Takayuki Yoshino;Yoshiaki Nakamura
Clinical Cancer Research  Published:May 18 2026
DOI:https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-25-4936

Abstract

Purpose: Methylthioadenosine phosphorylase (MTAP) is a tumor suppressor gene, with loss of MTAP occurring in approximately 15% of solid tumors; however, its molecular and clinicopathological significance remains incompletely defined.

Experimental Design: We conducted a multicenter observational study using two nationwide Japanese genomic screening programs, defining MTAP loss as homozygous deletion. In the MONSTAR-SCREEN-1 study (cohort A; n = 773), patients underwent tissue-based next-generation sequencing to evaluate MTAP status, co-alterations, clinical outcomes, and therapeutic efficacy. In MONSTAR-SCREEN-2 (cohort B; n = 714), multiomic analyses were conducted using whole exome and whole transcriptome sequencing, including xCell immune deconvolution and gene set enrichment analysis (GSEA), to characterize the tumor immune microenvironment and signaling pathways associated with MTAP loss.

Results: Among 764 patients in cohort A, MTAP loss was identified in 71 cases. MTAP loss strongly co-occurred with CDKN2A/B deletions and was associated with lower tumor mutational burden and microsatellite stable status. Patients with MTAP loss had significantly shorter overall and progression-free survival under immune checkpoint blockers (ICB) treatment. In MTAP loss tumors, transcriptomic analyses of cohort B revealed reduced infiltration of T cells, while GSEA showed enrichment of cell-cycle, RNA-processing, and DNA repair pathways, and depletion of immune-related and metabolic pathways.

Conclusions: MTAP loss defines a clinically adverse subset across advanced solid tumors, characterized by co-deletion of CDKN2A/B and type I interferon cluster genes, reduced T-cell infiltration, and resistance to ICB. These findings provide a mechanistic context for ICB resistance.

医療・健康
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