2023-05-08 スイス連邦工科大学チューリッヒ校(ETHZurich)
◆このアトラスは、視力を失う原因となる変性眼疾患の進行を止めるための研究を支援することができる。彼らは、さまざまな組織構造が異なる色で表示された網膜のクロスセクションの詳細をイメージングしており、人間の器官と同様に発達する3次元の組織塊である器官小体も使用している。
◆研究者たちは、このアトラスを人間の臓器および組織の発達に関する情報を提供するアトラスを作成する最初のステップとして位置付けている。
<関連情報>
- https://ethz.ch/en/news-and-events/eth-news/news/2023/05/detailed-image-of-the-human-retina.html
- https://www.nature.com/articles/s41587-023-01747-2
ヒト網膜オルガノイド発生のマルチモーダル時空間フェノタイピング Multimodal spatiotemporal phenotyping of human retinal organoid development
Philipp Wahle,Giovanna Brancati,Christoph Harmel,Zhisong He,Gabriele Gut,Jacobo Sarabia del Castillo,Aline Xavier da Silveira dos Santos,Qianhui Yu,Pascal Noser,Jonas Simon Fleck,Bruno Gjeta,Dinko Pavlinić,Simone Picelli,Max Hess,Gregor W. Schmidt,Tom T. A. Lummen,Yanyan Hou,Patricia Galliker,David Goldblum,Marton Balogh,Cameron S. Cowan,Hendrik P. N. Scholl,Botond Roska,Magdalena Renner,Lucas Pelkmans,Barbara Treutlein & J. Gray Camp
Nature Biotechnology Published:08 May 2023
DOI:https://doi.org/10.1038/s41587-023-01747-2
Abstract
Organoids generated from human pluripotent stem cells provide experimental systems to study development and disease, but quantitative measurements across different spatial scales and molecular modalities are lacking. In this study, we generated multiplexed protein maps over a retinal organoid time course and primary adult human retinal tissue. We developed a toolkit to visualize progenitor and neuron location, the spatial arrangements of extracellular and subcellular components and global patterning in each organoid and primary tissue. In addition, we generated a single-cell transcriptome and chromatin accessibility timecourse dataset and inferred a gene regulatory network underlying organoid development. We integrated genomic data with spatially segmented nuclei into a multimodal atlas to explore organoid patterning and retinal ganglion cell (RGC) spatial neighborhoods, highlighting pathways involved in RGC cell death and showing that mosaic genetic perturbations in retinal organoids provide insight into cell fate regulation.
